Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra2P26048 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms