Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NdnP25233 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NdnP25233 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NdnP25233 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NdnP25233 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NdnP25233 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NdnP25233 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NdnP25233 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms