Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gria1P23818 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms