Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tsta3P23591 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsta3P23591 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsta3P23591 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms