Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gja1P23242 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gja1P23242 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms