Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RarbP22605 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RarbP22605 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RarbP22605 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RarbP22605 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RarbP22605 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RarbP22605 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RarbP22605 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RarbP22605 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RarbP22605 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RarbP22605 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RarbP22605 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RarbP22605 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RarbP22605 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RarbP22605 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RarbP22605 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms