Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45bP22339 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45bP22339 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms