Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ms4a2P20490 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ms4a2P20490 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ms4a2P20490 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms