Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou5f1P20263 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou5f1P20263 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou5f1P20263 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms