Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsp1P19973 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsp1P19973 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms