Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
F2P19221 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F2P19221 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
F2P19221 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F2P19221 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
F2P19221 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F2P19221 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
F2P19221 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
F2P19221 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms