Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifrd1P19182 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifrd1P19182 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms