Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PcnaP17918 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PcnaP17918 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PcnaP17918 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms