Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptbp1P17225 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms