Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f1P17208 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f1P17208 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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