Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd44P15379 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd44P15379 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd44P15379 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd44P15379 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd44P15379 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms