Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpsaP14206 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RpsaP14206 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RpsaP14206 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RpsaP14206 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RpsaP14206 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms