Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dnmt1P13864 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dnmt1P13864 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnmt1P13864 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms