Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OtcP11725 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OtcP11725 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OtcP11725 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtcP11725 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OtcP11725 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OtcP11725 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OtcP11725 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtcP11725 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms