Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga5P11688 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga5P11688 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga5P11688 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga5P11688 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms