Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp1P11438 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp1P11438 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms