Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sub1P11031 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sub1P11031 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms