Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P10404 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P10404 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P10404 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P10404 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P10404 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P10404 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P10404 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P10404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P10404 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P10404 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms