Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl2P10148 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl2P10148 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms