Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CatspereP0DP43 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CatspereP0DP43 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms