Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Amd1P0DMN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Amd1P0DMN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms