Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly6c1P0CW02 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms