Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Igsf6P0C6B7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms