Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb7P09024 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb7P09024 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb7P09024 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms