Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NeflP08551 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NeflP08551 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NeflP08551 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NeflP08551 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NeflP08551 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NeflP08551 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NeflP08551 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NeflP08551 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NeflP08551 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NeflP08551 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NeflP08551 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NeflP08551 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NeflP08551 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NeflP08551 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NeflP08551 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NeflP08551 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NeflP08551 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NeflP08551 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NeflP08551 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NeflP08551 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NeflP08551 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NeflP08551 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms