Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna4P07351 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna4P07351 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms