Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TnfP06804 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TnfP06804 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TnfP06804 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TnfP06804 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TnfP06804 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TnfP06804 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TnfP06804 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TnfP06804 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TnfP06804 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TnfP06804 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TnfP06804 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TnfP06804 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms