Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PtprcP06800 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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PtprcP06800 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprcP06800 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PtprcP06800 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PtprcP06800 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PtprcP06800 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprcP06800 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprcP06800 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms