Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06335 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06335 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06335 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06335 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06335 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06335 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06335 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06335 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms