Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06323 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06323 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06323 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06323 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06323 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06323 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06323 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06323 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06323 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms