Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms