Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamb1P02469 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms