Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01797 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01797 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01797 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01797 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01797 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01797 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01797 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01797 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01797 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms