Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01658 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01658 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01658 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01658 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01658 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01658 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01658 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01658 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01658 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms