Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01649 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01649 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01649 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01649 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01649 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01649 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01649 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01649 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01649 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01649 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms