Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms