Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mtco2P00405 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtco2P00405 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms