Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc27a3O88561 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a3O88561 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms