Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nme6O88425 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme6O88425 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms