Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lnx1O70263 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms