Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfi1bO70237 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gfi1bO70237 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfi1bO70237 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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