Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tlx3O55144 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tlx3O55144 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlx3O55144 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms