Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap2O55126 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms