Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nipsnap1O55125 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms