Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syngr2O55101 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syngr2O55101 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms